ddSEQ™ – новый генератор капель производства компании Bio-Rad, позволяющий за 5 минут изолировать единичные клетки для последующего анализа транскриптома каждой отдельной клетки путем секвенирования нового поколения (NGS).
В приборе ddSEQ™ используется специальный картридж, в котором клетки и реагенты для лизиса и баркодирования автоматически соединяются в капле специального масла и изолируются.
Затем капли переносятся в 96-луночный планшет и помещаются в термоциклер, где происходит лизис клеток и обратная транскрипция с баркодированием. Остается только разбить эмульсию и переходить к подготовке библиотек!
изолировать 1 000–1 200 клеток в день;
обработать до четырех образцов за 5 минут;
быстро и качественно подготовить клетки к NGS-секвенированию.
Секвенирование РНК единичных клеток помогает в изучении функции клеток, развития заболеваний и определении терапевтических таргетов. С помощью изучения сотен и тысяч единичных клеток ученые могут разделять индивидуальные клетки в гетерогенной популяции.
обрабатывать от сотни до десятков тысяч клеток за один день;
характеризовать транскрипцию с большой чувствительностью;
изучать клетки вне зависимости от их размера.
Реакционной площадкой служит специальный картридж (8 х 3 лунки).
Одновременно картридж вмещает до 4 образцов.
В крайний нижний ряд помещается масло, в средний – через лунку образец с клетками и реагенты для лизиса и баркодирования клеток.
С использованием особых микрофлюидных технологий в ходе работы прибора формируются микроскопические капли масла (<1 нл), в каждую из которых попадает одна клетка и реагенты для лизиса и баркодирования.
клеточная дифференциация;
репрограммирование клетки;
характеристика клеточных субпопуляций;
изучение гетерогенности опухолей.
Количество образцов на один картридж |
4 |
Количество клеток, изолируемых за день |
1 000-1 200 |
Время изоляции клеток |
5 минут |
Требования к электросети |
100-240 В, 50/60 Гц, 60 Вт |
Размер, мм |
280 х 360 х 130 |
Вес, кг |
4,5 |